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免疫功能低下和病原菌暴露是造成儿童反复呼吸道感染的主要原因，多采用免疫调节剂治疗。益生菌可以通过多种途径参与局部和全身的免疫调节，包括定植抵抗力、增强自然杀伤细胞的数量与活性、释放细胞因子、提高抗体应答等。
呼吸道感染是儿科门诊就诊和住院病因的首位，包括上呼吸道感染（如普通感冒、急性中耳炎、扁桃体炎、鼻窦炎等）和下呼吸道感染（如支气管炎、肺炎等）。
反复呼吸道感染指1年以内发生次数频繁、超出正常范围的上、下呼吸道感染。是困扰家长和医师的常见问题，患儿需要经常就医，经常使用抗生素和住院治疗，甚至需要外科手术。反复呼吸道感染不仅影响小儿生长发育，也使家长承受巨大的精神与经济负担。
目前认为，机体免疫功能低下是造成反复呼吸道感染的主要原因，所以多主张采用免疫调节剂进行防治。免疫调节剂泛指调节、增强、兴奋和恢复机体免疫功能的药物，能增强淋巴细胞对抗原的免疫应答能力，提高机体内IgA、IgG水平，从而减少呼吸道感染的次数。目前临床应用的药物包括化学性免疫刺激剂（如匹多莫德、左旋咪唑）、生物制剂（如转移因子、胸腺肽）、细菌提取物（如卡介苗多糖、细菌溶解产物）等，临床疗效不一。
随着微生态学的进展，研究发现，益生菌能通过调节机体免疫功能，改善个体健康状况；系统评价表明，益生菌可有效预防呼吸道感染，减少急性呼吸道感染患病次数，减轻感染症状的严重性并缩短病程。
益生菌防治呼吸道感染的机制
益生菌是指一定数量的、能够对宿主健康产生有益作用的活的微生物。和肠道菌群一样，益生菌不仅在胃肠道发挥免疫作用，还可以影响全身免疫系统，此作用是由益生菌的促进黏膜免疫系统发育成熟和对黏膜免疫系统的调节作用介导的。
黏膜免疫系统是指广泛分布于胃肠道、呼吸道、泌尿生殖道黏膜下及一些外分泌腺体处的淋巴组织，是发挥局部免疫功能的主要场所，其中肠道是体内最大的免疫器官。各个部位的黏膜免疫不是孤立的，而是存在相互紧密联系的关系，肠道黏膜免疫系统中激活的T细胞和B细胞，能够到达多个黏膜相关淋巴组织（包括肠道、呼吸道、生殖道等），发挥针对同一抗原的免疫反应，这种情况称为共同黏膜免疫系统；这构成了口服益生菌能够对呼吸道黏膜免疫发挥作用的基础。
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